主要区别在于级别不同，从而导致待遇也会存在差异。公务员的职务分为领导职务和非领导职务，巡视员和调研员都属于非领导职务。巡视员和调研员的主要职责监督是相关职能部门的工作情况，并协助主要领导开展工作。


职级层次不同
公务员非领导职务改职级后，原来的处级非领导即副调研员和调研员，从两个层级被改成了一至四级调研员四个层级，一级调研员是最高层级，二级调研员次之，二级调研员要晋升一级调研员，必须在二级调研员岗位上任职满三年以上，才具备晋升一级调研员的资格。一级调研员各方面待遇都高于二级调研员。
工资待遇不同
公务员职级并行后，在正处级待遇有三个岗位：一级调研员、二级调研员、正处实职。单论工资待遇，二级调研员最低，其与正处实职在基础性工资上没有差异，区别主要集中在两项：工作性津贴，生活性补贴，这两项存在较大的地方性差异。 总体上二级调研员比正处实职要少300-400元，而正处实职又比一级调研员要少300多元，加起来二级调研员整体要比一级调研员每月工资少600-800元之间。 当然，以上都是应发额，扣除五险两金后实际到手不一定有这么多，且因为地方财政能力不同，各地存在一定的差异。其他方面比如车补、年终考核绩效，一级调研员和二级调研员都执行同等标准，没有实质上的区别。
发展前景不同
公务员职级并行后，职级之间的关系就像爬楼梯，必须一步步踩实了往上走，才能爬得更高。一级调研员和二级调研员的关系也是如此。从副处实职或者三级调研员晋升二级调研员，才有机会晋升正处实职或一级调研员，而一般只有拿到了一级调研员，也才有晋升二级巡视员或者副厅实职的机会。 换言之，一级调研员已经无限接近副厅待遇（任职满四年可以晋升二巡），而二级调研员别说副厅，晋升一级调研员最少尚需三年时间。一级调研员的发展先机远远高于二级调研员。 工作待遇不同。晋升一级调研员和二级调研员，按照公务员职务与职级并行规定实施细则规定，一般要求报告个人有关事项并进行查核。这是一二级调研员区别于三四级调研员较大的不同之处。 除此之外，一二调研员最大的不同是，一级调研员多数由正处实职晋升而来，有的是由正处实职兼任。而二级调研员一般由原来的调研员套改，或者由三级调研员晋升而来，很少由实职兼任的，前者可以享受正处实职的各项工作和政治待遇，比如办公用房、阅文、主持会议等，而后者往往不能享受。

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