1、学制不同：专本贯通学制为5年，前3年在专科院校学习，后2年在本科院校学习;本科即统招本科，一般学制为4年，医学类、建筑类专业学制为5年。
2、起点不同：专本贯通起点为高职专科层次报名;本科起点一般为高中应往届毕业生。
3、入学方式不同：专本贯通入学是由省考试院组织实施安排的;而本科入学是由统一安排的，由各省市具体实施，考试时间统一。
4、考试科目不同：专本贯通考试科目1门为英语(公共外语课为非英语的学生考大学语文)，1门为计算机(报考计算机科学与技术专业的学生考高等数学Ⅰ);本科入学考试为高考规定考试科目，考试科目与各省实施新高考方案有关，考试科目不同。主要考试语文、外语、数学，以及文综、理综或学业水平考试。
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